Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LOXL1Q08397 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms