Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CACNB2Q08289 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNB2Q08289 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms