Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF4Q08170 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF4Q08170 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms