Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CXCL9Q07325 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CXCL9Q07325 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms