Protein–RNA interactions for Protein: Q05215

EGR4, Early growth response protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR4Q05215 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EGR4Q05215 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms