Protein–RNA interactions for Protein: Q03923

ZNF85, Zinc finger protein 85, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF85Q03923 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF85Q03923 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms