Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GCNT1Q02742 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GCNT1Q02742 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms