Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYP27A1Q02318 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYP27A1Q02318 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms