Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SPIBQ01892 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms