Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A2Q01362 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms