Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRCDQ00LT1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRCDQ00LT1 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms