Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYBPC1Q00872 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYBPC1Q00872 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYBPC1Q00872 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYBPC1Q00872 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MYBPC1Q00872 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYBPC1Q00872 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYBPC1Q00872 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYBPC1Q00872 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYBPC1Q00872 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYBPC1Q00872 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYBPC1Q00872 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYBPC1Q00872 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MYBPC1Q00872 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYBPC1Q00872 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYBPC1Q00872 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYBPC1Q00872 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYBPC1Q00872 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYBPC1Q00872 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYBPC1Q00872 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYBPC1Q00872 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MYBPC1Q00872 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MYBPC1Q00872 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MYBPC1Q00872 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MYBPC1Q00872 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MYBPC1Q00872 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MYBPC1Q00872 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MYBPC1Q00872 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MYBPC1Q00872 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MYBPC1Q00872 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MYBPC1Q00872 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MYBPC1Q00872 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MYBPC1Q00872 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MYBPC1Q00872 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MYBPC1Q00872 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MYBPC1Q00872 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MYBPC1Q00872 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MYBPC1Q00872 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MYBPC1Q00872 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MYBPC1Q00872 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MYBPC1Q00872 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MYBPC1Q00872 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MYBPC1Q00872 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MYBPC1Q00872 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MYBPC1Q00872 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MYBPC1Q00872 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MYBPC1Q00872 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MYBPC1Q00872 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
MYBPC1Q00872 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
MYBPC1Q00872 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
MYBPC1Q00872 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MYBPC1Q00872 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms