Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDC42EP1Q00587 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDC42EP1Q00587 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms