Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PITPNAQ00169 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PITPNAQ00169 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PITPNAQ00169 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PITPNAQ00169 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PITPNAQ00169 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PITPNAQ00169 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITPNAQ00169 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITPNAQ00169 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITPNAQ00169 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITPNAQ00169 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITPNAQ00169 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITPNAQ00169 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITPNAQ00169 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITPNAQ00169 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITPNAQ00169 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITPNAQ00169 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PITPNAQ00169 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PITPNAQ00169 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITPNAQ00169 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PITPNAQ00169 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PITPNAQ00169 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PITPNAQ00169 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PITPNAQ00169 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PITPNAQ00169 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PITPNAQ00169 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITPNAQ00169 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITPNAQ00169 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PITPNAQ00169 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITPNAQ00169 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITPNAQ00169 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITPNAQ00169 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITPNAQ00169 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITPNAQ00169 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITPNAQ00169 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITPNAQ00169 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PITPNAQ00169 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PITPNAQ00169 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PITPNAQ00169 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PITPNAQ00169 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PITPNAQ00169 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PITPNAQ00169 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PITPNAQ00169 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PITPNAQ00169 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PITPNAQ00169 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PITPNAQ00169 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PITPNAQ00169 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PITPNAQ00169 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PITPNAQ00169 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PITPNAQ00169 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms