Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZBED6P86452 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZBED6P86452 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZBED6P86452 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZBED6P86452 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZBED6P86452 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZBED6P86452 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZBED6P86452 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZBED6P86452 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ZBED6P86452 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZBED6P86452 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZBED6P86452 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZBED6P86452 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZBED6P86452 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZBED6P86452 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZBED6P86452 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ZBED6P86452 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZBED6P86452 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ZBED6P86452 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZBED6P86452 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZBED6P86452 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ZBED6P86452 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZBED6P86452 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZBED6P86452 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZBED6P86452 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ZBED6P86452 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZBED6P86452 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZBED6P86452 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZBED6P86452 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZBED6P86452 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZBED6P86452 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZBED6P86452 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZBED6P86452 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ZBED6P86452 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZBED6P86452 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZBED6P86452 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZBED6P86452 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZBED6P86452 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZBED6P86452 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZBED6P86452 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZBED6P86452 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZBED6P86452 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZBED6P86452 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZBED6P86452 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZBED6P86452 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZBED6P86452 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ZBED6P86452 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZBED6P86452 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZBED6P86452 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZBED6P86452 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZBED6P86452 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZBED6P86452 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZBED6P86452 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZBED6P86452 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZBED6P86452 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZBED6P86452 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZBED6P86452 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZBED6P86452 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZBED6P86452 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZBED6P86452 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZBED6P86452 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZBED6P86452 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED6P86452 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED6P86452 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED6P86452 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED6P86452 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED6P86452 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED6P86452 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED6P86452 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED6P86452 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED6P86452 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED6P86452 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED6P86452 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED6P86452 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED6P86452 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED6P86452 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED6P86452 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED6P86452 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED6P86452 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED6P86452 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED6P86452 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED6P86452 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZBED6P86452 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZBED6P86452 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZBED6P86452 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZBED6P86452 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZBED6P86452 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZBED6P86452 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZBED6P86452 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ZBED6P86452 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZBED6P86452 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZBED6P86452 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZBED6P86452 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ZBED6P86452 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZBED6P86452 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZBED6P86452 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZBED6P86452 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZBED6P86452 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZBED6P86452 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZBED6P86452 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms