Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VBP1P61758 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VBP1P61758 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VBP1P61758 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VBP1P61758 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VBP1P61758 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VBP1P61758 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VBP1P61758 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VBP1P61758 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VBP1P61758 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VBP1P61758 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VBP1P61758 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VBP1P61758 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
VBP1P61758 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VBP1P61758 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VBP1P61758 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
VBP1P61758 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VBP1P61758 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VBP1P61758 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VBP1P61758 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VBP1P61758 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
VBP1P61758 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VBP1P61758 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VBP1P61758 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
VBP1P61758 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
VBP1P61758 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VBP1P61758 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
VBP1P61758 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VBP1P61758 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VBP1P61758 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VBP1P61758 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VBP1P61758 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VBP1P61758 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VBP1P61758 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VBP1P61758 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VBP1P61758 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VBP1P61758 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VBP1P61758 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VBP1P61758 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
VBP1P61758 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VBP1P61758 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VBP1P61758 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VBP1P61758 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VBP1P61758 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
VBP1P61758 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
VBP1P61758 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VBP1P61758 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VBP1P61758 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VBP1P61758 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VBP1P61758 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VBP1P61758 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VBP1P61758 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VBP1P61758 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VBP1P61758 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VBP1P61758 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VBP1P61758 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VBP1P61758 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VBP1P61758 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VBP1P61758 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VBP1P61758 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VBP1P61758 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VBP1P61758 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VBP1P61758 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VBP1P61758 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VBP1P61758 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VBP1P61758 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VBP1P61758 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VBP1P61758 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VBP1P61758 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VBP1P61758 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VBP1P61758 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VBP1P61758 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VBP1P61758 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VBP1P61758 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VBP1P61758 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VBP1P61758 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VBP1P61758 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VBP1P61758 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VBP1P61758 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VBP1P61758 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VBP1P61758 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VBP1P61758 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VBP1P61758 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VBP1P61758 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VBP1P61758 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VBP1P61758 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VBP1P61758 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VBP1P61758 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VBP1P61758 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VBP1P61758 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VBP1P61758 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VBP1P61758 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VBP1P61758 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VBP1P61758 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VBP1P61758 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VBP1P61758 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VBP1P61758 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VBP1P61758 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VBP1P61758 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VBP1P61758 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms