Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HERVK_113P61574 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms