Protein–RNA interactions for Protein: P61081

UBE2M, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2MP61081 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2MP61081 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms