Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2BFSP57053 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms