Protein–RNA interactions for Protein: P56693

SOX10, Transcription factor SOX-10, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX10P56693 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX10P56693 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX10P56693 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX10P56693 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX10P56693 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX10P56693 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX10P56693 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX10P56693 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX10P56693 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX10P56693 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX10P56693 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX10P56693 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX10P56693 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX10P56693 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX10P56693 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX10P56693 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX10P56693 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX10P56693 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX10P56693 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX10P56693 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX10P56693 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX10P56693 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX10P56693 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX10P56693 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX10P56693 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX10P56693 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX10P56693 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX10P56693 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX10P56693 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX10P56693 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX10P56693 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX10P56693 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX10P56693 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX10P56693 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX10P56693 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX10P56693 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX10P56693 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX10P56693 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX10P56693 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX10P56693 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX10P56693 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX10P56693 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX10P56693 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX10P56693 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX10P56693 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX10P56693 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX10P56693 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX10P56693 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX10P56693 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX10P56693 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX10P56693 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX10P56693 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX10P56693 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX10P56693 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX10P56693 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX10P56693 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX10P56693 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX10P56693 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX10P56693 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX10P56693 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX10P56693 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX10P56693 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX10P56693 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX10P56693 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX10P56693 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX10P56693 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX10P56693 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX10P56693 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX10P56693 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX10P56693 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX10P56693 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX10P56693 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX10P56693 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX10P56693 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX10P56693 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX10P56693 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX10P56693 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX10P56693 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX10P56693 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX10P56693 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX10P56693 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX10P56693 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX10P56693 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX10P56693 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX10P56693 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX10P56693 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX10P56693 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX10P56693 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX10P56693 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX10P56693 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX10P56693 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SOX10P56693 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SOX10P56693 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SOX10P56693 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX10P56693 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX10P56693 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX10P56693 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX10P56693 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX10P56693 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SOX10P56693 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms