Protein–RNA interactions for Protein: P56202

CTSW, Cathepsin W, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSWP56202 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTSWP56202 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTSWP56202 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTSWP56202 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTSWP56202 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTSWP56202 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTSWP56202 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTSWP56202 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTSWP56202 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTSWP56202 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTSWP56202 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTSWP56202 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTSWP56202 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTSWP56202 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTSWP56202 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTSWP56202 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTSWP56202 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTSWP56202 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTSWP56202 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTSWP56202 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTSWP56202 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTSWP56202 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTSWP56202 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTSWP56202 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTSWP56202 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CTSWP56202 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CTSWP56202 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTSWP56202 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTSWP56202 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTSWP56202 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTSWP56202 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTSWP56202 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTSWP56202 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTSWP56202 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTSWP56202 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTSWP56202 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTSWP56202 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTSWP56202 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTSWP56202 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTSWP56202 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTSWP56202 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTSWP56202 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTSWP56202 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTSWP56202 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTSWP56202 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTSWP56202 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTSWP56202 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTSWP56202 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTSWP56202 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTSWP56202 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTSWP56202 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTSWP56202 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTSWP56202 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTSWP56202 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTSWP56202 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTSWP56202 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTSWP56202 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTSWP56202 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTSWP56202 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTSWP56202 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTSWP56202 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTSWP56202 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTSWP56202 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTSWP56202 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTSWP56202 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTSWP56202 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTSWP56202 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTSWP56202 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTSWP56202 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTSWP56202 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CTSWP56202 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CTSWP56202 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CTSWP56202 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CTSWP56202 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTSWP56202 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTSWP56202 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTSWP56202 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTSWP56202 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTSWP56202 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTSWP56202 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CTSWP56202 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTSWP56202 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CTSWP56202 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTSWP56202 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTSWP56202 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTSWP56202 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTSWP56202 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTSWP56202 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTSWP56202 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTSWP56202 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTSWP56202 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTSWP56202 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTSWP56202 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTSWP56202 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTSWP56202 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTSWP56202 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTSWP56202 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTSWP56202 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTSWP56202 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTSWP56202 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms