Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP1B3P54709 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms