Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PGGT1BP53609 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
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PGGT1BP53609 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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PGGT1BP53609 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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PGGT1BP53609 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
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PGGT1BP53609 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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PGGT1BP53609 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PGGT1BP53609 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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