Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARFIP1P53367 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARFIP1P53367 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARFIP1P53367 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARFIP1P53367 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARFIP1P53367 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARFIP1P53367 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARFIP1P53367 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARFIP1P53367 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARFIP1P53367 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARFIP1P53367 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARFIP1P53367 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARFIP1P53367 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARFIP1P53367 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARFIP1P53367 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARFIP1P53367 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARFIP1P53367 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARFIP1P53367 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARFIP1P53367 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARFIP1P53367 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ARFIP1P53367 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARFIP1P53367 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARFIP1P53367 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARFIP1P53367 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARFIP1P53367 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ARFIP1P53367 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARFIP1P53367 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ARFIP1P53367 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARFIP1P53367 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARFIP1P53367 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARFIP1P53367 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARFIP1P53367 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARFIP1P53367 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARFIP1P53367 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARFIP1P53367 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARFIP1P53367 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARFIP1P53367 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
ARFIP1P53367 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARFIP1P53367 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARFIP1P53367 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARFIP1P53367 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARFIP1P53367 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARFIP1P53367 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARFIP1P53367 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARFIP1P53367 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms