Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP98P52948 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP98P52948 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NUP98P52948 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP98P52948 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP98P52948 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP98P52948 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP98P52948 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP98P52948 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP98P52948 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP98P52948 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP98P52948 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP98P52948 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP98P52948 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP98P52948 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP98P52948 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP98P52948 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP98P52948 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP98P52948 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP98P52948 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP98P52948 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NUP98P52948 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP98P52948 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP98P52948 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP98P52948 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP98P52948 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP98P52948 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP98P52948 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP98P52948 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP98P52948 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP98P52948 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP98P52948 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP98P52948 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP98P52948 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP98P52948 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP98P52948 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP98P52948 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP98P52948 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP98P52948 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP98P52948 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP98P52948 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NUP98P52948 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP98P52948 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP98P52948 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP98P52948 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP98P52948 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP98P52948 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP98P52948 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP98P52948 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP98P52948 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP98P52948 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP98P52948 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP98P52948 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP98P52948 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP98P52948 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP98P52948 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP98P52948 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP98P52948 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP98P52948 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NUP98P52948 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP98P52948 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP98P52948 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP98P52948 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP98P52948 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP98P52948 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP98P52948 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP98P52948 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP98P52948 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP98P52948 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP98P52948 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP98P52948 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP98P52948 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP98P52948 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NUP98P52948 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUP98P52948 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUP98P52948 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUP98P52948 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUP98P52948 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUP98P52948 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NUP98P52948 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUP98P52948 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUP98P52948 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUP98P52948 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUP98P52948 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUP98P52948 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUP98P52948 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUP98P52948 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUP98P52948 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUP98P52948 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUP98P52948 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUP98P52948 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUP98P52948 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUP98P52948 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NUP98P52948 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
NUP98P52948 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NUP98P52948 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NUP98P52948 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NUP98P52948 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NUP98P52948 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NUP98P52948 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms