Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC3P51654 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC3P51654 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC3P51654 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC3P51654 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC3P51654 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC3P51654 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC3P51654 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC3P51654 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC3P51654 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC3P51654 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC3P51654 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC3P51654 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC3P51654 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC3P51654 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC3P51654 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC3P51654 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC3P51654 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC3P51654 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC3P51654 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC3P51654 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC3P51654 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC3P51654 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC3P51654 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPC3P51654 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC3P51654 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC3P51654 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC3P51654 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC3P51654 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC3P51654 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC3P51654 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC3P51654 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC3P51654 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC3P51654 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC3P51654 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC3P51654 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC3P51654 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC3P51654 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC3P51654 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC3P51654 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC3P51654 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPC3P51654 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPC3P51654 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPC3P51654 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPC3P51654 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPC3P51654 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPC3P51654 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPC3P51654 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPC3P51654 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPC3P51654 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPC3P51654 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPC3P51654 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPC3P51654 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GPC3P51654 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPC3P51654 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPC3P51654 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPC3P51654 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPC3P51654 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPC3P51654 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPC3P51654 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC3P51654 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC3P51654 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC3P51654 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC3P51654 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC3P51654 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC3P51654 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC3P51654 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC3P51654 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC3P51654 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC3P51654 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC3P51654 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC3P51654 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC3P51654 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC3P51654 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPC3P51654 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC3P51654 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC3P51654 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC3P51654 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC3P51654 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC3P51654 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC3P51654 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC3P51654 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC3P51654 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC3P51654 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC3P51654 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC3P51654 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC3P51654 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC3P51654 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC3P51654 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GPC3P51654 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPC3P51654 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPC3P51654 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPC3P51654 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPC3P51654 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GPC3P51654 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPC3P51654 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GPC3P51654 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPC3P51654 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GPC3P51654 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GPC3P51654 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms