Protein–RNA interactions for Protein: P49760

CLK2, Dual specificity protein kinase CLK2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK2P49760 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLK2P49760 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLK2P49760 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLK2P49760 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLK2P49760 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLK2P49760 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLK2P49760 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLK2P49760 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLK2P49760 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLK2P49760 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLK2P49760 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLK2P49760 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLK2P49760 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLK2P49760 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLK2P49760 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLK2P49760 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CLK2P49760 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLK2P49760 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLK2P49760 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLK2P49760 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLK2P49760 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLK2P49760 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CLK2P49760 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLK2P49760 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CLK2P49760 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLK2P49760 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CLK2P49760 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLK2P49760 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLK2P49760 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLK2P49760 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLK2P49760 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLK2P49760 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLK2P49760 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CLK2P49760 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
CLK2P49760 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CLK2P49760 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLK2P49760 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLK2P49760 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLK2P49760 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLK2P49760 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLK2P49760 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLK2P49760 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLK2P49760 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLK2P49760 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLK2P49760 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLK2P49760 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLK2P49760 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CLK2P49760 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLK2P49760 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CLK2P49760 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLK2P49760 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLK2P49760 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLK2P49760 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLK2P49760 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLK2P49760 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLK2P49760 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLK2P49760 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLK2P49760 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLK2P49760 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLK2P49760 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLK2P49760 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLK2P49760 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLK2P49760 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLK2P49760 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLK2P49760 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLK2P49760 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLK2P49760 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLK2P49760 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLK2P49760 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLK2P49760 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLK2P49760 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLK2P49760 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLK2P49760 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLK2P49760 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLK2P49760 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLK2P49760 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLK2P49760 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLK2P49760 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLK2P49760 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLK2P49760 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLK2P49760 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLK2P49760 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLK2P49760 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLK2P49760 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLK2P49760 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLK2P49760 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLK2P49760 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLK2P49760 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLK2P49760 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLK2P49760 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLK2P49760 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLK2P49760 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLK2P49760 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CLK2P49760 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLK2P49760 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLK2P49760 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLK2P49760 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLK2P49760 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLK2P49760 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLK2P49760 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms