Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POU3F4P49335 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms