Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GCLMP48507 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GCLMP48507 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GCLMP48507 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GCLMP48507 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GCLMP48507 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GCLMP48507 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GCLMP48507 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GCLMP48507 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GCLMP48507 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GCLMP48507 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GCLMP48507 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GCLMP48507 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GCLMP48507 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GCLMP48507 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GCLMP48507 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GCLMP48507 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GCLMP48507 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GCLMP48507 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GCLMP48507 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GCLMP48507 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GCLMP48507 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GCLMP48507 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GCLMP48507 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GCLMP48507 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GCLMP48507 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GCLMP48507 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GCLMP48507 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GCLMP48507 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GCLMP48507 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GCLMP48507 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GCLMP48507 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GCLMP48507 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GCLMP48507 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GCLMP48507 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GCLMP48507 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GCLMP48507 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GCLMP48507 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GCLMP48507 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GCLMP48507 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GCLMP48507 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GCLMP48507 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GCLMP48507 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GCLMP48507 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GCLMP48507 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GCLMP48507 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GCLMP48507 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GCLMP48507 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GCLMP48507 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GCLMP48507 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GCLMP48507 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GCLMP48507 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GCLMP48507 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GCLMP48507 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GCLMP48507 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GCLMP48507 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GCLMP48507 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GCLMP48507 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GCLMP48507 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GCLMP48507 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GCLMP48507 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GCLMP48507 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GCLMP48507 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GCLMP48507 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GCLMP48507 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GCLMP48507 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GCLMP48507 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GCLMP48507 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GCLMP48507 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GCLMP48507 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GCLMP48507 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GCLMP48507 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GCLMP48507 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GCLMP48507 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GCLMP48507 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GCLMP48507 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GCLMP48507 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GCLMP48507 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GCLMP48507 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GCLMP48507 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GCLMP48507 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCLMP48507 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCLMP48507 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCLMP48507 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCLMP48507 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCLMP48507 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCLMP48507 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCLMP48507 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCLMP48507 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCLMP48507 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCLMP48507 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCLMP48507 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCLMP48507 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCLMP48507 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCLMP48507 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCLMP48507 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCLMP48507 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCLMP48507 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCLMP48507 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GCLMP48507 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms