Protein–RNA interactions for Protein: P43699

NKX2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-1P43699 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms