Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GDF5P43026 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GDF5P43026 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GDF5P43026 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GDF5P43026 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GDF5P43026 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GDF5P43026 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GDF5P43026 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GDF5P43026 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GDF5P43026 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GDF5P43026 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GDF5P43026 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GDF5P43026 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GDF5P43026 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GDF5P43026 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GDF5P43026 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GDF5P43026 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GDF5P43026 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GDF5P43026 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GDF5P43026 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GDF5P43026 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GDF5P43026 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GDF5P43026 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GDF5P43026 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GDF5P43026 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GDF5P43026 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GDF5P43026 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GDF5P43026 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GDF5P43026 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GDF5P43026 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GDF5P43026 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GDF5P43026 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GDF5P43026 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GDF5P43026 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GDF5P43026 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GDF5P43026 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GDF5P43026 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GDF5P43026 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GDF5P43026 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GDF5P43026 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GDF5P43026 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GDF5P43026 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GDF5P43026 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GDF5P43026 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GDF5P43026 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GDF5P43026 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GDF5P43026 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GDF5P43026 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GDF5P43026 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GDF5P43026 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GDF5P43026 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GDF5P43026 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GDF5P43026 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GDF5P43026 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GDF5P43026 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GDF5P43026 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GDF5P43026 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GDF5P43026 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GDF5P43026 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GDF5P43026 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GDF5P43026 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GDF5P43026 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GDF5P43026 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GDF5P43026 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDF5P43026 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDF5P43026 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDF5P43026 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GDF5P43026 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDF5P43026 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDF5P43026 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDF5P43026 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDF5P43026 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDF5P43026 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDF5P43026 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDF5P43026 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDF5P43026 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDF5P43026 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDF5P43026 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDF5P43026 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDF5P43026 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDF5P43026 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDF5P43026 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDF5P43026 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDF5P43026 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDF5P43026 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDF5P43026 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDF5P43026 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDF5P43026 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GDF5P43026 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GDF5P43026 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GDF5P43026 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GDF5P43026 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GDF5P43026 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GDF5P43026 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GDF5P43026 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GDF5P43026 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GDF5P43026 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GDF5P43026 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GDF5P43026 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GDF5P43026 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms