Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL35P42766 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL35P42766 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL35P42766 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL35P42766 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL35P42766 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL35P42766 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL35P42766 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL35P42766 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL35P42766 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL35P42766 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL35P42766 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL35P42766 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL35P42766 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL35P42766 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL35P42766 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL35P42766 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL35P42766 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL35P42766 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL35P42766 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL35P42766 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL35P42766 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL35P42766 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL35P42766 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL35P42766 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL35P42766 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL35P42766 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL35P42766 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL35P42766 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL35P42766 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL35P42766 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL35P42766 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL35P42766 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL35P42766 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL35P42766 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL35P42766 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL35P42766 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL35P42766 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL35P42766 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL35P42766 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL35P42766 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL35P42766 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL35P42766 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL35P42766 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL35P42766 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL35P42766 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL35P42766 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL35P42766 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL35P42766 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL35P42766 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL35P42766 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL35P42766 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL35P42766 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL35P42766 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL35P42766 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL35P42766 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL35P42766 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL35P42766 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL35P42766 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL35P42766 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL35P42766 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL35P42766 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL35P42766 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL35P42766 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL35P42766 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL35P42766 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL35P42766 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL35P42766 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL35P42766 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL35P42766 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL35P42766 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL35P42766 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL35P42766 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL35P42766 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL35P42766 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL35P42766 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL35P42766 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL35P42766 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL35P42766 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL35P42766 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL35P42766 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL35P42766 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL35P42766 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL35P42766 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL35P42766 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL35P42766 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL35P42766 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL35P42766 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL35P42766 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL35P42766 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL35P42766 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL35P42766 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL35P42766 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL35P42766 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL35P42766 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL35P42766 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL35P42766 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL35P42766 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL35P42766 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL35P42766 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms