Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACTR1BP42025 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTR1BP42025 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTR1BP42025 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTR1BP42025 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTR1BP42025 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTR1BP42025 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTR1BP42025 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTR1BP42025 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTR1BP42025 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTR1BP42025 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTR1BP42025 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTR1BP42025 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTR1BP42025 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTR1BP42025 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTR1BP42025 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTR1BP42025 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTR1BP42025 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTR1BP42025 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTR1BP42025 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTR1BP42025 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTR1BP42025 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTR1BP42025 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTR1BP42025 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTR1BP42025 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTR1BP42025 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTR1BP42025 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTR1BP42025 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTR1BP42025 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTR1BP42025 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTR1BP42025 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTR1BP42025 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTR1BP42025 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTR1BP42025 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTR1BP42025 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTR1BP42025 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms