Protein–RNA interactions for Protein: P39059

COL15A1, Collagen alpha-1(XV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL15A1P39059 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL15A1P39059 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL15A1P39059 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL15A1P39059 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL15A1P39059 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL15A1P39059 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL15A1P39059 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL15A1P39059 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL15A1P39059 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL15A1P39059 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
COL15A1P39059 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL15A1P39059 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL15A1P39059 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL15A1P39059 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL15A1P39059 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
COL15A1P39059 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL15A1P39059 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL15A1P39059 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL15A1P39059 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL15A1P39059 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL15A1P39059 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL15A1P39059 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
COL15A1P39059 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL15A1P39059 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL15A1P39059 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL15A1P39059 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL15A1P39059 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL15A1P39059 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
COL15A1P39059 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL15A1P39059 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL15A1P39059 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL15A1P39059 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL15A1P39059 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL15A1P39059 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL15A1P39059 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL15A1P39059 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL15A1P39059 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL15A1P39059 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
COL15A1P39059 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL15A1P39059 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL15A1P39059 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL15A1P39059 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL15A1P39059 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
COL15A1P39059 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
COL15A1P39059 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
COL15A1P39059 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
COL15A1P39059 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL15A1P39059 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL15A1P39059 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL15A1P39059 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL15A1P39059 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL15A1P39059 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL15A1P39059 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL15A1P39059 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL15A1P39059 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL15A1P39059 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL15A1P39059 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL15A1P39059 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL15A1P39059 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL15A1P39059 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL15A1P39059 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL15A1P39059 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL15A1P39059 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL15A1P39059 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL15A1P39059 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL15A1P39059 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL15A1P39059 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL15A1P39059 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL15A1P39059 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL15A1P39059 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL15A1P39059 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL15A1P39059 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL15A1P39059 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL15A1P39059 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL15A1P39059 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL15A1P39059 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL15A1P39059 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL15A1P39059 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL15A1P39059 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL15A1P39059 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL15A1P39059 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL15A1P39059 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL15A1P39059 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL15A1P39059 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL15A1P39059 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL15A1P39059 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL15A1P39059 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL15A1P39059 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL15A1P39059 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL15A1P39059 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL15A1P39059 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL15A1P39059 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL15A1P39059 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL15A1P39059 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL15A1P39059 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL15A1P39059 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL15A1P39059 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL15A1P39059 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL15A1P39059 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL15A1P39059 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms