Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TGFBR1P36897 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TGFBR1P36897 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms