Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP6P35125 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
USP6P35125 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP6P35125 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP6P35125 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP6P35125 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
USP6P35125 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP6P35125 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP6P35125 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
USP6P35125 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP6P35125 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP6P35125 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP6P35125 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP6P35125 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP6P35125 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP6P35125 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP6P35125 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP6P35125 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP6P35125 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP6P35125 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP6P35125 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP6P35125 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP6P35125 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP6P35125 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP6P35125 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP6P35125 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP6P35125 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP6P35125 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP6P35125 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP6P35125 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP6P35125 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP6P35125 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP6P35125 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP6P35125 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP6P35125 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP6P35125 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP6P35125 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP6P35125 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP6P35125 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP6P35125 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP6P35125 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP6P35125 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP6P35125 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP6P35125 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP6P35125 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP6P35125 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP6P35125 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP6P35125 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
USP6P35125 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
USP6P35125 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP6P35125 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP6P35125 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP6P35125 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP6P35125 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP6P35125 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP6P35125 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP6P35125 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP6P35125 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP6P35125 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP6P35125 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
USP6P35125 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP6P35125 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP6P35125 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP6P35125 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP6P35125 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP6P35125 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP6P35125 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP6P35125 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP6P35125 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP6P35125 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP6P35125 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP6P35125 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP6P35125 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP6P35125 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP6P35125 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP6P35125 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
USP6P35125 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP6P35125 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP6P35125 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP6P35125 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP6P35125 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP6P35125 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP6P35125 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
USP6P35125 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP6P35125 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP6P35125 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP6P35125 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP6P35125 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP6P35125 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP6P35125 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP6P35125 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP6P35125 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP6P35125 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP6P35125 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP6P35125 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP6P35125 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP6P35125 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP6P35125 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP6P35125 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP6P35125 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms