Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
ABCD1P33897 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ABCD1P33897 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms