Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DSG3P32926 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DSG3P32926 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DSG3P32926 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DSG3P32926 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DSG3P32926 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DSG3P32926 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DSG3P32926 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DSG3P32926 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DSG3P32926 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DSG3P32926 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DSG3P32926 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DSG3P32926 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DSG3P32926 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DSG3P32926 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DSG3P32926 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DSG3P32926 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DSG3P32926 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DSG3P32926 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DSG3P32926 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DSG3P32926 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DSG3P32926 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DSG3P32926 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DSG3P32926 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DSG3P32926 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DSG3P32926 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DSG3P32926 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DSG3P32926 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DSG3P32926 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DSG3P32926 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DSG3P32926 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DSG3P32926 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DSG3P32926 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DSG3P32926 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DSG3P32926 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DSG3P32926 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DSG3P32926 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DSG3P32926 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
DSG3P32926 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DSG3P32926 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DSG3P32926 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DSG3P32926 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DSG3P32926 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DSG3P32926 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DSG3P32926 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DSG3P32926 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DSG3P32926 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DSG3P32926 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DSG3P32926 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DSG3P32926 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DSG3P32926 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DSG3P32926 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DSG3P32926 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DSG3P32926 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DSG3P32926 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DSG3P32926 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DSG3P32926 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DSG3P32926 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DSG3P32926 COA4-204ENST00000541455 1038 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DSG3P32926 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DSG3P32926 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DSG3P32926 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DSG3P32926 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DSG3P32926 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DSG3P32926 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DSG3P32926 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DSG3P32926 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DSG3P32926 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DSG3P32926 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DSG3P32926 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DSG3P32926 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DSG3P32926 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DSG3P32926 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DSG3P32926 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DSG3P32926 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DSG3P32926 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DSG3P32926 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DSG3P32926 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DSG3P32926 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DSG3P32926 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DSG3P32926 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DSG3P32926 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DSG3P32926 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DSG3P32926 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DSG3P32926 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DSG3P32926 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DSG3P32926 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DSG3P32926 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DSG3P32926 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DSG3P32926 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DSG3P32926 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DSG3P32926 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DSG3P32926 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DSG3P32926 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DSG3P32926 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DSG3P32926 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DSG3P32926 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DSG3P32926 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DSG3P32926 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DSG3P32926 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms