Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GCAP28676 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GCAP28676 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GCAP28676 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GCAP28676 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GCAP28676 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GCAP28676 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GCAP28676 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GCAP28676 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GCAP28676 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GCAP28676 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GCAP28676 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GCAP28676 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GCAP28676 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GCAP28676 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GCAP28676 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GCAP28676 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GCAP28676 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GCAP28676 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GCAP28676 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GCAP28676 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GCAP28676 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GCAP28676 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GCAP28676 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GCAP28676 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GCAP28676 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GCAP28676 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GCAP28676 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCAP28676 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCAP28676 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCAP28676 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCAP28676 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCAP28676 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCAP28676 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCAP28676 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCAP28676 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCAP28676 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCAP28676 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GCAP28676 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCAP28676 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GCAP28676 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GCAP28676 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCAP28676 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCAP28676 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCAP28676 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GCAP28676 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCAP28676 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCAP28676 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCAP28676 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GCAP28676 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCAP28676 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GCAP28676 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCAP28676 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCAP28676 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCAP28676 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCAP28676 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCAP28676 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCAP28676 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCAP28676 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCAP28676 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCAP28676 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCAP28676 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCAP28676 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCAP28676 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCAP28676 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCAP28676 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCAP28676 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCAP28676 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCAP28676 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCAP28676 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCAP28676 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCAP28676 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCAP28676 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCAP28676 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCAP28676 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCAP28676 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCAP28676 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCAP28676 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCAP28676 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCAP28676 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GCAP28676 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCAP28676 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCAP28676 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCAP28676 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCAP28676 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GCAP28676 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GCAP28676 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GCAP28676 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GCAP28676 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GCAP28676 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GCAP28676 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GCAP28676 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GCAP28676 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GCAP28676 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GCAP28676 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GCAP28676 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GCAP28676 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GCAP28676 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GCAP28676 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GCAP28676 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms