Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAMP1P23763 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAMP1P23763 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms