Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPRDP23468 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRDP23468 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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