Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHA1P21709 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms