Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA5P20719 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA5P20719 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms