Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ATP4AP20648 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ATP4AP20648 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms