Protein–RNA interactions for Protein: P15941

MUC1, Mucin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC1P15941 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MUC1P15941 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MUC1P15941 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MUC1P15941 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MUC1P15941 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MUC1P15941 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MUC1P15941 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MUC1P15941 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MUC1P15941 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MUC1P15941 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MUC1P15941 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MUC1P15941 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MUC1P15941 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MUC1P15941 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MUC1P15941 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MUC1P15941 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MUC1P15941 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MUC1P15941 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MUC1P15941 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MUC1P15941 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MUC1P15941 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MUC1P15941 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MUC1P15941 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MUC1P15941 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MUC1P15941 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MUC1P15941 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MUC1P15941 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MUC1P15941 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUC1P15941 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUC1P15941 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUC1P15941 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUC1P15941 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUC1P15941 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUC1P15941 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUC1P15941 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUC1P15941 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUC1P15941 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUC1P15941 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUC1P15941 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUC1P15941 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUC1P15941 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUC1P15941 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUC1P15941 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUC1P15941 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUC1P15941 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MUC1P15941 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUC1P15941 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MUC1P15941 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUC1P15941 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUC1P15941 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUC1P15941 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MUC1P15941 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUC1P15941 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUC1P15941 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUC1P15941 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUC1P15941 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUC1P15941 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUC1P15941 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUC1P15941 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUC1P15941 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUC1P15941 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MUC1P15941 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MUC1P15941 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MUC1P15941 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MUC1P15941 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MUC1P15941 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MUC1P15941 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MUC1P15941 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MUC1P15941 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MUC1P15941 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MUC1P15941 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MUC1P15941 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MUC1P15941 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MUC1P15941 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MUC1P15941 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MUC1P15941 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MUC1P15941 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MUC1P15941 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MUC1P15941 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MUC1P15941 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MUC1P15941 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MUC1P15941 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MUC1P15941 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MUC1P15941 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MUC1P15941 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MUC1P15941 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MUC1P15941 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MUC1P15941 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MUC1P15941 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MUC1P15941 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MUC1P15941 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MUC1P15941 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MUC1P15941 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MUC1P15941 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MUC1P15941 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MUC1P15941 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MUC1P15941 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MUC1P15941 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MUC1P15941 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MUC1P15941 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms