Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDH1P12830 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDH1P12830 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDH1P12830 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDH1P12830 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDH1P12830 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDH1P12830 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDH1P12830 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CDH1P12830 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDH1P12830 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDH1P12830 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDH1P12830 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDH1P12830 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDH1P12830 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDH1P12830 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDH1P12830 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDH1P12830 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDH1P12830 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDH1P12830 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDH1P12830 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDH1P12830 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CDH1P12830 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CDH1P12830 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDH1P12830 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDH1P12830 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDH1P12830 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDH1P12830 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDH1P12830 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDH1P12830 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDH1P12830 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDH1P12830 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDH1P12830 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDH1P12830 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDH1P12830 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDH1P12830 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDH1P12830 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDH1P12830 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDH1P12830 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CDH1P12830 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDH1P12830 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDH1P12830 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDH1P12830 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDH1P12830 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDH1P12830 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDH1P12830 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDH1P12830 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDH1P12830 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CDH1P12830 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CDH1P12830 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDH1P12830 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDH1P12830 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDH1P12830 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDH1P12830 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDH1P12830 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDH1P12830 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDH1P12830 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDH1P12830 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CDH1P12830 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDH1P12830 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CDH1P12830 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CDH1P12830 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CDH1P12830 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CDH1P12830 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CDH1P12830 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CDH1P12830 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDH1P12830 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDH1P12830 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDH1P12830 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDH1P12830 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDH1P12830 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDH1P12830 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDH1P12830 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDH1P12830 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDH1P12830 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDH1P12830 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDH1P12830 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDH1P12830 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDH1P12830 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDH1P12830 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDH1P12830 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDH1P12830 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDH1P12830 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CDH1P12830 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDH1P12830 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDH1P12830 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDH1P12830 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDH1P12830 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDH1P12830 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDH1P12830 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDH1P12830 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CDH1P12830 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDH1P12830 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDH1P12830 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CDH1P12830 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDH1P12830 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CDH1P12830 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CDH1P12830 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDH1P12830 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDH1P12830 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDH1P12830 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms