Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC12.55□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC12.54□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms