Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MS4A1P11836 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MS4A1P11836 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms