Protein–RNA interactions for Protein: P10720

PF4V1, Platelet factor 4 variant, humanhuman

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4V1P10720 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PF4V1P10720 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms