Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHGAP10645 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHGAP10645 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHGAP10645 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHGAP10645 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHGAP10645 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHGAP10645 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHGAP10645 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHGAP10645 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHGAP10645 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHGAP10645 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHGAP10645 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHGAP10645 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHGAP10645 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHGAP10645 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHGAP10645 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHGAP10645 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHGAP10645 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHGAP10645 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHGAP10645 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHGAP10645 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHGAP10645 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHGAP10645 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CHGAP10645 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHGAP10645 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHGAP10645 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CHGAP10645 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHGAP10645 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHGAP10645 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHGAP10645 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHGAP10645 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHGAP10645 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHGAP10645 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHGAP10645 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHGAP10645 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHGAP10645 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHGAP10645 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHGAP10645 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHGAP10645 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHGAP10645 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHGAP10645 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHGAP10645 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHGAP10645 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHGAP10645 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHGAP10645 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHGAP10645 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHGAP10645 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHGAP10645 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHGAP10645 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHGAP10645 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHGAP10645 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHGAP10645 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CHGAP10645 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHGAP10645 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHGAP10645 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CHGAP10645 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHGAP10645 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHGAP10645 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHGAP10645 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHGAP10645 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHGAP10645 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CHGAP10645 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CHGAP10645 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CHGAP10645 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CHGAP10645 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHGAP10645 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHGAP10645 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHGAP10645 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHGAP10645 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHGAP10645 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHGAP10645 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHGAP10645 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHGAP10645 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CHGAP10645 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHGAP10645 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHGAP10645 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHGAP10645 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHGAP10645 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CHGAP10645 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHGAP10645 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CHGAP10645 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHGAP10645 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CHGAP10645 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CHGAP10645 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHGAP10645 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHGAP10645 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHGAP10645 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHGAP10645 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHGAP10645 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHGAP10645 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHGAP10645 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CHGAP10645 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHGAP10645 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CHGAP10645 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHGAP10645 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHGAP10645 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHGAP10645 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHGAP10645 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CHGAP10645 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CHGAP10645 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms